MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 101901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012943	GCC	2	6	24263	24268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796935
502	NC_012943	GCTG	2	8	24297	24304	0 %	25 %	50 %	25 %	253796935
503	NC_012943	CGTAGT	2	12	24331	24342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253796935
504	NC_012943	CGGC	2	8	24345	24352	0 %	0 %	50 %	50 %	253796935
505	NC_012943	GAG	2	6	24376	24381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796935
506	NC_012943	GCC	3	9	24428	24436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796935
507	NC_012943	GCCG	2	8	24445	24452	0 %	0 %	50 %	50 %	253796935
508	NC_012943	CGGG	2	8	24520	24527	0 %	0 %	75 %	25 %	253796935
509	NC_012943	CTC	2	6	24557	24562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796935
510	NC_012943	CCG	2	6	24597	24602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796935
511	NC_012943	GCC	2	6	24614	24619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796935
512	NC_012943	GCC	2	6	24638	24643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796935
513	NC_012943	GCCGG	2	10	24690	24699	0 %	0 %	60 %	40 %	253796935
514	NC_012943	AGG	2	6	24707	24712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796935
515	NC_012943	GCG	2	6	24727	24732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796935
516	NC_012943	C	6	6	24738	24743	0 %	0 %	0 %	100 %	253796935
517	NC_012943	CCTGGT	2	12	24769	24780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796935
518	NC_012943	GCC	2	6	24923	24928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796935
519	NC_012943	C	6	6	24944	24949	0 %	0 %	0 %	100 %	253796935
520	NC_012943	CCA	2	6	24981	24986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796935
521	NC_012943	GTC	2	6	25016	25021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796935
522	NC_012943	TCG	2	6	25029	25034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796935
523	NC_012943	GCCCCT	2	12	25039	25050	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	253796935
524	NC_012943	CGG	2	6	25145	25150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796935
525	NC_012943	CGA	2	6	25211	25216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796935
526	NC_012943	GAC	2	6	25229	25234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796935
527	NC_012943	ATG	2	6	25356	25361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796935
528	NC_012943	GCC	2	6	25413	25418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796935
529	NC_012943	GCA	2	6	25426	25431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796935
530	NC_012943	GC	3	6	26022	26027	0 %	0 %	50 %	50 %	253796936
531	NC_012943	CGC	2	6	26045	26050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796936
532	NC_012943	TTG	2	6	26051	26056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796936
533	NC_012943	CGG	2	6	26077	26082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796936
534	NC_012943	CGG	2	6	26119	26124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796936
535	NC_012943	GCA	2	6	26151	26156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796936
536	NC_012943	CTT	2	6	26182	26187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796936
537	NC_012943	GT	3	6	26256	26261	0 %	50 %	50 %	0 %	253796936
538	NC_012943	GTG	2	6	26301	26306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796936
539	NC_012943	GTC	2	6	26315	26320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796936
540	NC_012943	GCC	2	6	26328	26333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796936
541	NC_012943	AGC	2	6	26334	26339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796936
542	NC_012943	CGG	2	6	26407	26412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796936
543	NC_012943	CGG	2	6	26428	26433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796936
544	NC_012943	CGG	2	6	26461	26466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796936
545	NC_012943	CG	3	6	26490	26495	0 %	0 %	50 %	50 %	253796936
546	NC_012943	CGA	2	6	26506	26511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796936
547	NC_012943	CCA	2	6	26578	26583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796936
548	NC_012943	GCTC	2	8	26607	26614	0 %	25 %	25 %	50 %	253796936
549	NC_012943	CGG	2	6	26656	26661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796936
550	NC_012943	AGC	2	6	26742	26747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796936
551	NC_012943	TGA	2	6	26773	26778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796936
552	NC_012943	GCG	2	6	26802	26807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796936
553	NC_012943	CCAA	2	8	26824	26831	50 %	0 %	0 %	50 %	253796936
554	NC_012943	GCC	2	6	26846	26851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796936
555	NC_012943	CAGC	2	8	26890	26897	25 %	0 %	25 %	50 %	253796936
556	NC_012943	CCG	2	6	26901	26906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796936
557	NC_012943	CAC	2	6	26978	26983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796936
558	NC_012943	CAC	2	6	27167	27172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796937
559	NC_012943	CAG	2	6	27215	27220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796937
560	NC_012943	CGC	2	6	27256	27261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796937
561	NC_012943	GCA	2	6	27274	27279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796937
562	NC_012943	CGT	2	6	27280	27285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796937
563	NC_012943	GCC	2	6	27320	27325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796937
564	NC_012943	GCT	2	6	27394	27399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796937
565	NC_012943	GCG	2	6	27471	27476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796937
566	NC_012943	CGT	2	6	27487	27492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796937
567	NC_012943	CGGC	2	8	27710	27717	0 %	0 %	50 %	50 %	253796938
568	NC_012943	GGC	2	6	27768	27773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796938
569	NC_012943	CA	3	6	27830	27835	50 %	0 %	0 %	50 %	253796938
570	NC_012943	GCC	2	6	27873	27878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796938
571	NC_012943	CGC	2	6	27903	27908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796938
572	NC_012943	CGC	2	6	27939	27944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796938
573	NC_012943	CCG	2	6	27969	27974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796938
574	NC_012943	GTC	2	6	27985	27990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796938
575	NC_012943	CGA	2	6	28079	28084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796938
576	NC_012943	TC	3	6	28110	28115	0 %	50 %	0 %	50 %	253796938
577	NC_012943	GCC	2	6	28150	28155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796938
578	NC_012943	CCGG	2	8	28196	28203	0 %	0 %	50 %	50 %	253796938
579	NC_012943	CG	3	6	28235	28240	0 %	0 %	50 %	50 %	253796938
580	NC_012943	GC	3	6	28241	28246	0 %	0 %	50 %	50 %	253796938
581	NC_012943	GTC	2	6	28302	28307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796938
582	NC_012943	TCGGCG	2	12	28337	28348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253796938
583	NC_012943	CGA	2	6	28350	28355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796938
584	NC_012943	GC	3	6	28394	28399	0 %	0 %	50 %	50 %	253796938
585	NC_012943	TCG	2	6	28418	28423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796938
586	NC_012943	ACG	2	6	28442	28447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796938
587	NC_012943	GCA	2	6	28458	28463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796938
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589	NC_012943	CAC	2	6	28547	28552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796939
590	NC_012943	CTG	2	6	28566	28571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796939
591	NC_012943	GGC	2	6	28640	28645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796939
592	NC_012943	CTG	2	6	28654	28659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796939
593	NC_012943	TCA	2	6	28687	28692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796939
594	NC_012943	CGG	2	6	28722	28727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796939
595	NC_012943	CGA	2	6	28745	28750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796939
596	NC_012943	GCTC	2	8	28752	28759	0 %	25 %	25 %	50 %	253796939
597	NC_012943	ACC	2	6	28764	28769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796939
598	NC_012943	CGT	2	6	28812	28817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796939
599	NC_012943	GC	4	8	28829	28836	0 %	0 %	50 %	50 %	253796939
600	NC_012943	CGA	2	6	28860	28865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796939
601	NC_012943	ACG	2	6	28871	28876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796939
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603	NC_012943	TGCG	2	8	28891	28898	0 %	25 %	50 %	25 %	253796939
604	NC_012943	CGC	2	6	28988	28993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796939
605	NC_012943	CAC	2	6	29105	29110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796939
606	NC_012943	CCGG	2	8	29156	29163	0 %	0 %	50 %	50 %	253796939
607	NC_012943	CAA	2	6	29210	29215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796939
608	NC_012943	GTC	2	6	29220	29225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796939
609	NC_012943	CAA	2	6	29270	29275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796939
610	NC_012943	GGCAA	2	10	29403	29412	40 %	0 %	40 %	20 %	253796940
611	NC_012943	ACG	2	6	29414	29419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796940
612	NC_012943	GC	3	6	29462	29467	0 %	0 %	50 %	50 %	253796940
613	NC_012943	CGTC	2	8	29487	29494	0 %	25 %	25 %	50 %	253796940
614	NC_012943	CG	3	6	29524	29529	0 %	0 %	50 %	50 %	253796940
615	NC_012943	GGATCA	2	12	29535	29546	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253796940
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617	NC_012943	GTC	2	6	29623	29628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796940
618	NC_012943	GCC	3	9	29629	29637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796940
619	NC_012943	CACG	2	8	29847	29854	25 %	0 %	25 %	50 %	253796941
620	NC_012943	ACCG	2	8	29928	29935	25 %	0 %	25 %	50 %	253796941
621	NC_012943	GGT	2	6	29946	29951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796941
622	NC_012943	CGC	2	6	30057	30062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796941
623	NC_012943	AGC	2	6	30084	30089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796941
624	NC_012943	GTC	2	6	30133	30138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796941
625	NC_012943	CGATC	2	10	30229	30238	20 %	20 %	20 %	40 %	253796941
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